南大公共管理硕士课程由十二门课加一篇综合分析应用报告组成。其中五门为必修课，另外七门为选修课，学员可根据自己的兴趣选择科目。顺利完成学业的学员将获得南洋理工大学公共管理硕士学位(MPA)。除了以上正式的课程，也将根据学员的需要安排额外的英语等不计学分的补充课程。

南大公共管理硕士课程在一年内分三个学期完成。全部学习过程在南洋理工大学进行。每学期平均修四门课程并完成相应学科的考试。专题讲座通常由政府官员、著名学者和企业家主讲。参观主要安排到新加坡政府机构或企业，与新加坡政府官员及企业界成功人士进行交流。在第二学期结束后，学校将组织学员进行大约两周的海外学习考察活动，了解海外国家的政府和企业的运作情况。